Mittlerweile benutze ich den Webfilemanager schon einige Monate.
Ich entwickele mit Eclipse auf meinem lokalen Windows-PC und schiebe die Dateien (mehrere gleichzeitig) auf den Server. Das schöne, wenn ich in den Dateien dann wieder ändere, brauche ich den WFM nur mit F5 neu laden und meine neuen Dateien sind wieder auf dem Server. Kleinere Änderungen mache ich schon mal direkt auf dem Server, aber eher selten. Ansonsten finde ich die Suche von Dateien sehr hilfreich und die Schnellsprung-Funktion zwischen den Verzeichnissen. Diese fand ich allerdings anfangs schwer zu verstehen.
Durch das Online-Handbuch habe ich schon so manche verstecke Funktion gefunden, die sich nicht auf Anhieb erschlossen hat.
Die neue Version 5.3.4 stopft wohl ein Sicherheitsleck. Da bei mir sowieso eine Apache-Authentifizierung den Ordner schützt, hätte ich das nicht gebraucht. Aber sicher ist sicher.
Für mich ist die Software WFM für PHP-Webmaster eine absolute Empfehlung wert.